Về mặt hành chính, vườn quốc gia thuộc huyện Chirang và Baksa, bang Assam, Ấn Độ. Nó được bao phủ bởi những cánh rừng rậm nằm ở chân đồi phía đông dãy núi Himalaya. Sông Manas chảy qua phía tây vườn quốc gia cũng là dòng chảy chính. Nó là một nhánh chính của sông Brahmaputra và tách thành hai con sông Bwrsi và Bholkaduba khi chảy xuống đồng bằng. Năm con sông nhỏ khác cũng chảy qua vườn quốc gia nằm trên một thềm phù sa rộng, thấp trải rộng dưới chân đồi bên ngoài dãy núi Himalaya. Sông Manas cũng chính là biên giới quốc tế giữa Ấn Độ và Bhutan. Phía bắc của vườn quốc gia là savan với địa chất đá vôi và sa thạch trong khi đồng cỏ phía nam hình thành trên các lớp trầm tích.

Tổng diện tích của vườn quốc gia là 950 km2 với độ cao dao động từ 61-110 mét so với mực nước biển trung bình. Khí hậu tương đối dễ chịu, từ 15-37 độ C. Mùa mưa tại vườn quốc gia tập trung từ tháng 5 đến tháng 9 với tổng lượng mưa trung bình năm là 333 cm.